許恩旗助研究員

許恩旗 助研究員
分子與基因醫學研究所
連絡電話:35360

E-mail:enchi@nhri.edu.tw

 

 

 

 

 

學歷

美國俄亥俄州立大學藥物化學博士 (2014)

國立陽明大學 微生物暨免疫學碩士 (2004)

國立陽明大學 生命科學系學士 (2002)

 

經歷

2022-目前       國家衛生研究院 分子與基因醫學研究所 研究員

2020-2022      美國史丹佛大學 癌症早期偵測-卡納里中心 科學家

2016-2020      美國史丹佛大學 癌症早期偵測-卡納里中心 博士後研究員

2014-2015      美國俄亥俄州立大學 藥學院藥物化學所 博士後研究員

2006-2009      中央研究院 生物醫學科學研究所 研究助理

 

研究興趣

歡迎來到我們的實驗室!許博士對腫瘤發生的不同階段有著廣泛的興趣。我們擁有強大的研究工具,包括利用基因表達操作、膜蛋白質交互作用整體分析、癌症基因體與蛋白質體學整合分析方法、患者來源的異種移植癌 (PDX) 、患者來源的組織培養與轉植、以及癌轉移小鼠模型,用來研究癌症發展的臨床相關基礎分子機制與跨領域引導的應用開發。歡迎任何跨學科或產學合作,歡迎具有不同專業知識的人才加入我的實驗室。隨時聯繫我。我們的實驗室為癌症治療和診斷創造新技術和應用。我們的願景是將我們的研究發現轉化為臨床應用,我們的使命是通過我們的研究盡可能多地造福癌症患者。

 

1) 癌症的早期發現 (Cancer Early Detection)

癌症早期檢測是在癌症惡化之前儘早結束癌症的最佳方法,越早發現癌症能極大地延長患者的生存率。特別是肝癌與胰腺癌的早期因為沒有症狀與缺少良好的生物標識物提供例行篩檢,導致病人發現罹癌已經為時已晚,腫瘤大小早已影響到器官功能或轉移散落至身體各處,許博士在史丹佛大學已開發出一套前列腺癌外泌體 (exosome)生物標誌物的篩選平台,因此我們將善用這套經驗在台灣與臨床醫生合作,開發基於液體活檢(liquid biopsy)的癌症外泌體生物標誌物,外泌體 miRNA 轉錄體相關特徵,來發展肝癌和胰腺癌進行早期檢測的診斷依據產品。

2) 癌症治療產生的抗藥性與細胞系譜的分化可塑性(Lineage Plasticity)

癌症治療的過程常常會產生抗藥性,癌細胞是如何產生抗藥性的呢?其中一種方式是分化成與原本不同特性的癌細胞。我們實驗室對於藥物治療所重新啟動的細胞系譜的分化可塑能力(therapy-acquired lineage plasticity)很感興趣,腺癌(adenocarcinoma)逆分化成神經內分泌癌(neuroendocrine tumors)的現象罕見卻又普遍存在各種腺癌裡,包括前列腺癌、肺癌、乳癌、與消化系統癌都發現這樣的分化可塑性,常常這樣的轉變使得治療失效並使癌細胞的特性更為惡性。我們可以找到新的標靶來阻止這樣的分化可塑性嗎?我們可以監察與預測病人在治療的過程這些分化的過程嗎?我們實驗室將針對這些目標利用轉錄體學與蛋白質體學 (transcriptomics & proteomics) 分析臨床檢體與利用患者來源的異種移植癌 (PDX)模型來探討與找尋重要的逆分化關鍵基因。

3) 癌轉移的器官趨向性 (Metastatic Organotropism)

癌轉移是導致罹癌患者的死亡主因之一。其中相較於轉移至其他器官,轉移至肝臟的病患與最差的存活率息息相關,這樣的關聯性在前列腺癌、大腸癌、乳癌、以及肺癌都是一致的。因此去解碼肝轉移特異性基因組改變是迫切需要解決的臨床重要問題,藉由全球基因組學研究領域的迅速發展,許博士發展出一套有效的分析方法融合基因體變異與癌轉移機率的新概念來解析癌轉移的器官特異性(metastatic organotropism),並命名為”MetaCode”,藉此找出癌細胞轉移至肝臟的成因,我們的目標是了解其中的機制並找出抑制甚至預防癌細胞肝臟轉移的治療新方法。這個分析方法將應用在多種癌症包括前列腺癌、大腸癌、乳癌、以及肺癌,我們將整合多種癌症類型尋找與癌轉移至肝臟的共同的分子機制或找到屬於各種癌症獨特的訊息傳遞,作為設計標靶治療的新方向。

4) 癌細胞的膜表面地圖集計畫 (Cancer Surface Atlas Project)

蛋白質之間的交互作用是調控蛋白質功能與訊息傳遞的重要因子。然而,由於傳統的免疫沈澱方式(Immunoprecipitation)會破壞細胞膜,因此要了解在細胞膜上的膜蛋白質之間自然的交互作用有一定的困難度,也較少研究針對這方面做深入的大量的分析。我們實驗室將鑽研大量的癌表面膜蛋白交互作用體 (cancer surface interactome),在於獲得這些資料能在癌症的偵測或治療上具有大量潛在的應用價值,比如特異性的表面蛋白聚合體易於開發抗體偵測也易於作為標靶來攻擊癌細胞。為此,我們實驗室會結合多種獨特的技術來了解前列腺癌、肝癌、與胰臟腺癌的膜蛋白交互作用體,包括 BioID, RIME, in situ PLA, bio-layer interferometry, and antibody-based hyperplexed imaging 來描繪癌細胞的表面與看清癌細胞上的膜蛋白聚合體。我們的最終目標是發展出辨識癌特異性的humanized antibodies 並加以運用作為 imaging and targeting theranostic molecular probe。

榮譽與獲獎

2021-2022       SPARK Translational Research Program Pilot Grant. Stanford University, USA

2020-2021       Spectrum MedTech Pilot Grant. Stanford University, USA

2020                 The Society for Basic Urologic Research (SBUR) Annual Meeting Travel Award, USA

2020                 International Alliance for Cancer Early Detection (ACED) – Invited Talk, UK

2013                 The Albert H. Soloway Award in Pharmacy and Cancer Research. The Ohio State University, USA

2012-2014       Pelatonia Graduate Fellowship. The Ohio State University, USA

2012                 Pharmacy Research Day Award. The Ohio State University, USA

2004                 National Yang-Ming University Academic Thesis Competition Award, Taiwan

2002               International Meeting on Molecular Biology of Hepatitis B Viruses Travel Award, USA

 

近期代表研究著作

  1. Aslan M*, Hsu EC*, Garcia-Marques F, Bermudez A, Liu S, Shen M, Rice MA, West RB, Pitteri SJ, Győrffy B, Stoyanova T. (2021) A novel oncogene-mediated metabolic gene signature predicts breast cancer outcome. npj Breast Cancer. 7(1):141. *These authors contributed equally. PMID: 34711841
  2. Aslan M*, Hsu EC*, Liu S, Stoyanova T. (2021) Quantifying the invasion and migration ability of cancer cells with a 3D Matrigel drop invasion assay. Biol Methods Protoc. 6(1):bpab014. *These authors contributed equally. PMID: 34377838
  3. Hsu EC, Shen M, Aslan M, Liu S, Garcia-Marques F, Pitteri SJ, Nelson PS, Nguyen HM, Corey E, Brooks JD, and Stoyanova T. (2021) MCM2-7 complex is a novel druggable target for neuroendocrine prostate cancer. Scientific Report. 11(1):13305. PMID: 34172788
  4. Chen YS, Zhao Y, Beinat C, Zlitni A, Hsu EC, Chen DH, Achterberg F, Wang H, Stoyanova T, Dionne J, Gambhir SS. (2021) Ultra-High-Frequency-Radio-Frequency-Acoustic Molecular Imaging with Saline Nanodroplets in Living Subjects. Nature Nanotechnology. 16(6):717-724. PMID: 33782588
  5. Ghoochani A, Hsu EC, Aslan M, Rice MA, Nguyen HM, Brooks JD, Corey E, Paulmurugan R and Stoyanova T. (2021) Ferroptosis induction is a novel therapeutic approach for advanced prostate cancer. Cancer Research. 81(6):1583-1594. PMID: 33483372
  6. Liu S, Shen M, Hsu EC, Zhang CA, Garcia-Marques F, Nolley R, Koul K, Rice MA, Aslan M, Pitteri SJ, Massie C, George A, Brooks JD, Gnanapragasam VJ, Stoyanova T. (2020) Discovery of PTN as a serum-based biomarker of pro-metastatic prostate cancer. Br J Cancer. 124(5):896-900. PMID: 33288843
  7. Hsu EC, Rice MA, Bermudez A, Marques FJG, Aslan M, Liu S, Ghoochani A, Zhang CA, Chen YS, Zlitni A, Kumar S, Nolley R, Habte F, Shen M, Koul K, Peehl DM, Zoubeidi A, Gambhir SS, Kunder CA, Pitteri SJ, Brooks JD, Stoyanova T. (2020) Trop2 is a driver of metastatic prostate cancer with neuroendocrine phenotype via PARP1. Proc Natl Acad Sci U S A. 117(4):2032-2042. PMID: 31932422
  8. Rice MA, Hsu EC, Aslan M, Ghoochani A, Su A, Stoyanova T. (2019) Loss of Notch1 activity inhibits prostate cancer growth and metastasis and sensitizes prostate cancer cells to anti-androgen therapies. Molecular Cancer Therapeutics 18(7):1230-1242. PMID: 31028097
  9.  Yeh HW, Hsu EC, Lang YD, Gu DL, Shih JH, Chen CF, Chen CT, Tu PH and Jou YS. (2018) PSPC1 mediates TGFβ1 autocrine signaling and Smad2/3 target switching to promote EMT, stemness, and metastasis. Nature Cell Biology 20(4):479-491. PMID: 29593326
  10. Liu F, Vermesh O, Mani V, Ge TJ, Madsen SJ, Sabour A, Hsu EC, Gowrishankar G, Kanada M, Jokerst JV, Sierra RG, Chang E, Lau K, Sridhar K, Bermudez A, Pitteri SJ, Stoyanova T, Sinclair R, Nair VS, Gambhir SS, Demirci U. (2017) The Exosome Total Isolation Chip. ACS Nano 11(11):10712-10723.PMID: 29090896

 

 

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